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環境監測領域的樣品是微波消解的典型應用對象。土壤與沉積物中含有大量有機質、硅酸鹽等難分解成分，傳統消解需長時間加熱且易殘留未溶顆粒，而微波消解的高溫高壓環境能快速破壞土壤結構，使其中的重金屬（如 Pb、Cd、Cr）充分溶出，滿足環境評價中對痕量元素檢測的需求。水體中的懸浮物、底泥等樣品，通過微波消解可將顆粒物完全分解，避免傳統過濾步驟導致的元素損失，更準確反映水體污染狀況。此外，大氣降塵、工業廢渣等固體廢棄物，也可通過微波消解轉化為均勻溶液，用于后續的元素組成分析。

生物醫藥與臨床樣品的前處理對精度與安全性要求嚴苛，微波消解的特性使其成為理想選擇。血液、尿液等體液樣品中的微量元素（如 Fe、Zn、Se）是反映人體健康狀態的重要指標，微波消解的低污染風險與高回收率確保了檢測結果的可靠性。動物組織、植物樣本（如中藥材）中的活性成分與污染物，通過微波消解可轉化為適合儀器分析的溶液狀態，且全罐控壓技術避免了揮發性成分損失，適合藥效成分與有害殘留物的同時分析。醫療器械中的金屬鍍層、高分子材料，也可通過微波消解進行成分篩查，保障生物相容性。